Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ1

CLUAP1, Clusterin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUAP1Q96AJ1 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLUAP1Q96AJ1 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLUAP1Q96AJ1 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLUAP1Q96AJ1 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLUAP1Q96AJ1 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLUAP1Q96AJ1 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLUAP1Q96AJ1 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CLUAP1Q96AJ1 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLUAP1Q96AJ1 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLUAP1Q96AJ1 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLUAP1Q96AJ1 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLUAP1Q96AJ1 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLUAP1Q96AJ1 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLUAP1Q96AJ1 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLUAP1Q96AJ1 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLUAP1Q96AJ1 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLUAP1Q96AJ1 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLUAP1Q96AJ1 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLUAP1Q96AJ1 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLUAP1Q96AJ1 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLUAP1Q96AJ1 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLUAP1Q96AJ1 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLUAP1Q96AJ1 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLUAP1Q96AJ1 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLUAP1Q96AJ1 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLUAP1Q96AJ1 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLUAP1Q96AJ1 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLUAP1Q96AJ1 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLUAP1Q96AJ1 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLUAP1Q96AJ1 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLUAP1Q96AJ1 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLUAP1Q96AJ1 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLUAP1Q96AJ1 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLUAP1Q96AJ1 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLUAP1Q96AJ1 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLUAP1Q96AJ1 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLUAP1Q96AJ1 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLUAP1Q96AJ1 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLUAP1Q96AJ1 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLUAP1Q96AJ1 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CLUAP1Q96AJ1 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLUAP1Q96AJ1 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLUAP1Q96AJ1 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLUAP1Q96AJ1 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLUAP1Q96AJ1 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLUAP1Q96AJ1 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLUAP1Q96AJ1 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLUAP1Q96AJ1 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLUAP1Q96AJ1 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLUAP1Q96AJ1 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLUAP1Q96AJ1 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLUAP1Q96AJ1 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLUAP1Q96AJ1 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLUAP1Q96AJ1 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLUAP1Q96AJ1 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLUAP1Q96AJ1 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLUAP1Q96AJ1 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLUAP1Q96AJ1 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLUAP1Q96AJ1 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLUAP1Q96AJ1 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLUAP1Q96AJ1 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLUAP1Q96AJ1 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLUAP1Q96AJ1 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLUAP1Q96AJ1 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLUAP1Q96AJ1 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLUAP1Q96AJ1 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLUAP1Q96AJ1 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLUAP1Q96AJ1 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLUAP1Q96AJ1 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLUAP1Q96AJ1 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLUAP1Q96AJ1 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLUAP1Q96AJ1 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLUAP1Q96AJ1 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLUAP1Q96AJ1 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLUAP1Q96AJ1 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLUAP1Q96AJ1 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLUAP1Q96AJ1 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLUAP1Q96AJ1 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CLUAP1Q96AJ1 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLUAP1Q96AJ1 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLUAP1Q96AJ1 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLUAP1Q96AJ1 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLUAP1Q96AJ1 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLUAP1Q96AJ1 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLUAP1Q96AJ1 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLUAP1Q96AJ1 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLUAP1Q96AJ1 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLUAP1Q96AJ1 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLUAP1Q96AJ1 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLUAP1Q96AJ1 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLUAP1Q96AJ1 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLUAP1Q96AJ1 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CLUAP1Q96AJ1 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLUAP1Q96AJ1 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLUAP1Q96AJ1 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CLUAP1Q96AJ1 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
CLUAP1Q96AJ1 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CLUAP1Q96AJ1 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CLUAP1Q96AJ1 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CLUAP1Q96AJ1 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms