Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms