Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms