Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms