Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms