Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
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