Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms