Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA2D4Q7Z3S7 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA2D4Q7Z3S7 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA2D4Q7Z3S7 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA2D4Q7Z3S7 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA2D4Q7Z3S7 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA2D4Q7Z3S7 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA2D4Q7Z3S7 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA2D4Q7Z3S7 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA2D4Q7Z3S7 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA2D4Q7Z3S7 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA2D4Q7Z3S7 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA2D4Q7Z3S7 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA2D4Q7Z3S7 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA2D4Q7Z3S7 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA2D4Q7Z3S7 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA2D4Q7Z3S7 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA2D4Q7Z3S7 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA2D4Q7Z3S7 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA2D4Q7Z3S7 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA2D4Q7Z3S7 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA2D4Q7Z3S7 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA2D4Q7Z3S7 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA2D4Q7Z3S7 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA2D4Q7Z3S7 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA2D4Q7Z3S7 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA2D4Q7Z3S7 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA2D4Q7Z3S7 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA2D4Q7Z3S7 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA2D4Q7Z3S7 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA2D4Q7Z3S7 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA2D4Q7Z3S7 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA2D4Q7Z3S7 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA2D4Q7Z3S7 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA2D4Q7Z3S7 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA2D4Q7Z3S7 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA2D4Q7Z3S7 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA2D4Q7Z3S7 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA2D4Q7Z3S7 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA2D4Q7Z3S7 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA2D4Q7Z3S7 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA2D4Q7Z3S7 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA2D4Q7Z3S7 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA2D4Q7Z3S7 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA2D4Q7Z3S7 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA2D4Q7Z3S7 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA2D4Q7Z3S7 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA2D4Q7Z3S7 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA2D4Q7Z3S7 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA2D4Q7Z3S7 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA2D4Q7Z3S7 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA2D4Q7Z3S7 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA2D4Q7Z3S7 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA2D4Q7Z3S7 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA2D4Q7Z3S7 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA2D4Q7Z3S7 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA2D4Q7Z3S7 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA2D4Q7Z3S7 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA2D4Q7Z3S7 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms