Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms