Protein–RNA interactions for Protein: Q6VVB1

NHLRC1, E3 ubiquitin-protein ligase NHLRC1, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC1Q6VVB1 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NHLRC1Q6VVB1 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NHLRC1Q6VVB1 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NHLRC1Q6VVB1 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NHLRC1Q6VVB1 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NHLRC1Q6VVB1 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NHLRC1Q6VVB1 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NHLRC1Q6VVB1 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NHLRC1Q6VVB1 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NHLRC1Q6VVB1 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NHLRC1Q6VVB1 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NHLRC1Q6VVB1 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NHLRC1Q6VVB1 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NHLRC1Q6VVB1 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NHLRC1Q6VVB1 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NHLRC1Q6VVB1 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NHLRC1Q6VVB1 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NHLRC1Q6VVB1 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NHLRC1Q6VVB1 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NHLRC1Q6VVB1 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NHLRC1Q6VVB1 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NHLRC1Q6VVB1 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NHLRC1Q6VVB1 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NHLRC1Q6VVB1 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NHLRC1Q6VVB1 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NHLRC1Q6VVB1 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NHLRC1Q6VVB1 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NHLRC1Q6VVB1 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NHLRC1Q6VVB1 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NHLRC1Q6VVB1 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NHLRC1Q6VVB1 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NHLRC1Q6VVB1 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NHLRC1Q6VVB1 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NHLRC1Q6VVB1 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NHLRC1Q6VVB1 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NHLRC1Q6VVB1 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NHLRC1Q6VVB1 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NHLRC1Q6VVB1 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NHLRC1Q6VVB1 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NHLRC1Q6VVB1 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NHLRC1Q6VVB1 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NHLRC1Q6VVB1 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NHLRC1Q6VVB1 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NHLRC1Q6VVB1 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NHLRC1Q6VVB1 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NHLRC1Q6VVB1 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NHLRC1Q6VVB1 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NHLRC1Q6VVB1 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NHLRC1Q6VVB1 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NHLRC1Q6VVB1 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NHLRC1Q6VVB1 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NHLRC1Q6VVB1 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NHLRC1Q6VVB1 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NHLRC1Q6VVB1 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NHLRC1Q6VVB1 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NHLRC1Q6VVB1 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NHLRC1Q6VVB1 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NHLRC1Q6VVB1 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NHLRC1Q6VVB1 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NHLRC1Q6VVB1 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NHLRC1Q6VVB1 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NHLRC1Q6VVB1 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NHLRC1Q6VVB1 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NHLRC1Q6VVB1 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NHLRC1Q6VVB1 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NHLRC1Q6VVB1 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NHLRC1Q6VVB1 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NHLRC1Q6VVB1 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NHLRC1Q6VVB1 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NHLRC1Q6VVB1 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NHLRC1Q6VVB1 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NHLRC1Q6VVB1 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NHLRC1Q6VVB1 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NHLRC1Q6VVB1 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NHLRC1Q6VVB1 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NHLRC1Q6VVB1 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NHLRC1Q6VVB1 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NHLRC1Q6VVB1 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NHLRC1Q6VVB1 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NHLRC1Q6VVB1 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NHLRC1Q6VVB1 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NHLRC1Q6VVB1 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NHLRC1Q6VVB1 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NHLRC1Q6VVB1 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NHLRC1Q6VVB1 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NHLRC1Q6VVB1 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NHLRC1Q6VVB1 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NHLRC1Q6VVB1 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NHLRC1Q6VVB1 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NHLRC1Q6VVB1 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NHLRC1Q6VVB1 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NHLRC1Q6VVB1 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NHLRC1Q6VVB1 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NHLRC1Q6VVB1 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NHLRC1Q6VVB1 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NHLRC1Q6VVB1 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NHLRC1Q6VVB1 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NHLRC1Q6VVB1 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NHLRC1Q6VVB1 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NHLRC1Q6VVB1 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms