Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms