Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms