Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms