Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF20Q5VTR2 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms