Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms