Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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