Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms