Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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RNF212Q495C1 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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RNF212Q495C1 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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RNF212Q495C1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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RNF212Q495C1 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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RNF212Q495C1 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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RNF212Q495C1 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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RNF212Q495C1 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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RNF212Q495C1 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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RNF212Q495C1 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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RNF212Q495C1 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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