Protein–RNA interactions for Protein: Q30201

HFE, Hereditary hemochromatosis protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFEQ30201 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HFEQ30201 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HFEQ30201 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HFEQ30201 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HFEQ30201 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HFEQ30201 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HFEQ30201 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HFEQ30201 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HFEQ30201 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HFEQ30201 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HFEQ30201 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HFEQ30201 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HFEQ30201 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HFEQ30201 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HFEQ30201 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HFEQ30201 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HFEQ30201 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HFEQ30201 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HFEQ30201 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HFEQ30201 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
HFEQ30201 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
HFEQ30201 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HFEQ30201 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HFEQ30201 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HFEQ30201 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HFEQ30201 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HFEQ30201 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HFEQ30201 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HFEQ30201 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HFEQ30201 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HFEQ30201 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HFEQ30201 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HFEQ30201 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HFEQ30201 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HFEQ30201 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HFEQ30201 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HFEQ30201 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HFEQ30201 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HFEQ30201 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HFEQ30201 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HFEQ30201 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HFEQ30201 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HFEQ30201 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HFEQ30201 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HFEQ30201 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HFEQ30201 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HFEQ30201 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HFEQ30201 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HFEQ30201 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HFEQ30201 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HFEQ30201 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HFEQ30201 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HFEQ30201 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HFEQ30201 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HFEQ30201 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HFEQ30201 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HFEQ30201 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HFEQ30201 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HFEQ30201 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HFEQ30201 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HFEQ30201 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HFEQ30201 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HFEQ30201 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HFEQ30201 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HFEQ30201 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HFEQ30201 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HFEQ30201 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HFEQ30201 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HFEQ30201 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HFEQ30201 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HFEQ30201 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HFEQ30201 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HFEQ30201 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HFEQ30201 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HFEQ30201 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HFEQ30201 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HFEQ30201 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HFEQ30201 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HFEQ30201 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HFEQ30201 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HFEQ30201 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HFEQ30201 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HFEQ30201 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HFEQ30201 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HFEQ30201 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HFEQ30201 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HFEQ30201 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HFEQ30201 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HFEQ30201 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HFEQ30201 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HFEQ30201 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HFEQ30201 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HFEQ30201 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HFEQ30201 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HFEQ30201 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HFEQ30201 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HFEQ30201 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HFEQ30201 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HFEQ30201 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HFEQ30201 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms