Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
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