Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
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