Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
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