Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIK4Q16099 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIK4Q16099 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIK4Q16099 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIK4Q16099 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIK4Q16099 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIK4Q16099 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIK4Q16099 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIK4Q16099 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIK4Q16099 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIK4Q16099 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIK4Q16099 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIK4Q16099 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIK4Q16099 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIK4Q16099 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIK4Q16099 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIK4Q16099 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIK4Q16099 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIK4Q16099 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIK4Q16099 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIK4Q16099 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIK4Q16099 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIK4Q16099 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIK4Q16099 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIK4Q16099 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIK4Q16099 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIK4Q16099 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIK4Q16099 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIK4Q16099 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIK4Q16099 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIK4Q16099 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIK4Q16099 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIK4Q16099 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIK4Q16099 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIK4Q16099 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIK4Q16099 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIK4Q16099 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIK4Q16099 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIK4Q16099 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIK4Q16099 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIK4Q16099 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIK4Q16099 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIK4Q16099 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIK4Q16099 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIK4Q16099 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIK4Q16099 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIK4Q16099 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIK4Q16099 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK4Q16099 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK4Q16099 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK4Q16099 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK4Q16099 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK4Q16099 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK4Q16099 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK4Q16099 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK4Q16099 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK4Q16099 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK4Q16099 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK4Q16099 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK4Q16099 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK4Q16099 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK4Q16099 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK4Q16099 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK4Q16099 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK4Q16099 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK4Q16099 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK4Q16099 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK4Q16099 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK4Q16099 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK4Q16099 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK4Q16099 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK4Q16099 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK4Q16099 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK4Q16099 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK4Q16099 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK4Q16099 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK4Q16099 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK4Q16099 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK4Q16099 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK4Q16099 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK4Q16099 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK4Q16099 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK4Q16099 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK4Q16099 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK4Q16099 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK4Q16099 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK4Q16099 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK4Q16099 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK4Q16099 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK4Q16099 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK4Q16099 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK4Q16099 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK4Q16099 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK4Q16099 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK4Q16099 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK4Q16099 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK4Q16099 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIK4Q16099 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIK4Q16099 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIK4Q16099 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
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