Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC15.08■□□□□ 0
USF2Q15853 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
USF2Q15853 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
USF2Q15853 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
USF2Q15853 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
USF2Q15853 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
USF2Q15853 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
USF2Q15853 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
USF2Q15853 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
USF2Q15853 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USF2Q15853 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
USF2Q15853 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USF2Q15853 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
USF2Q15853 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USF2Q15853 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
USF2Q15853 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USF2Q15853 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
USF2Q15853 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USF2Q15853 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USF2Q15853 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USF2Q15853 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USF2Q15853 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USF2Q15853 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USF2Q15853 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
USF2Q15853 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
USF2Q15853 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
USF2Q15853 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
USF2Q15853 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USF2Q15853 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
USF2Q15853 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC15.07■□□□□ 0
USF2Q15853 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
USF2Q15853 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
USF2Q15853 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USF2Q15853 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USF2Q15853 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
USF2Q15853 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USF2Q15853 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
USF2Q15853 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
USF2Q15853 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USF2Q15853 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USF2Q15853 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USF2Q15853 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
USF2Q15853 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
USF2Q15853 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
USF2Q15853 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
USF2Q15853 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USF2Q15853 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USF2Q15853 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
USF2Q15853 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USF2Q15853 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USF2Q15853 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
USF2Q15853 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
USF2Q15853 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
USF2Q15853 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USF2Q15853 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USF2Q15853 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
USF2Q15853 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USF2Q15853 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USF2Q15853 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USF2Q15853 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USF2Q15853 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USF2Q15853 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
USF2Q15853 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
USF2Q15853 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USF2Q15853 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USF2Q15853 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.06■□□□□ 0
USF2Q15853 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USF2Q15853 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
USF2Q15853 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USF2Q15853 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USF2Q15853 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
USF2Q15853 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USF2Q15853 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USF2Q15853 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
USF2Q15853 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC15.06■□□□□ 0
USF2Q15853 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
USF2Q15853 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC15.06■□□□□ 0
USF2Q15853 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC15.06■□□□□ 0
USF2Q15853 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
USF2Q15853 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
USF2Q15853 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
USF2Q15853 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USF2Q15853 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
USF2Q15853 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
USF2Q15853 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
USF2Q15853 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USF2Q15853 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USF2Q15853 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USF2Q15853 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USF2Q15853 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USF2Q15853 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
USF2Q15853 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USF2Q15853 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC15.06■□□□□ 0
USF2Q15853 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
USF2Q15853 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
USF2Q15853 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
USF2Q15853 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
USF2Q15853 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
USF2Q15853 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
USF2Q15853 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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