Protein–RNA interactions for Protein: Q156A1

ATXN8, Ataxin-8, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN8Q156A1 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATXN8Q156A1 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATXN8Q156A1 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATXN8Q156A1 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATXN8Q156A1 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ATXN8Q156A1 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ATXN8Q156A1 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ATXN8Q156A1 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ATXN8Q156A1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ATXN8Q156A1 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ATXN8Q156A1 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ATXN8Q156A1 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ATXN8Q156A1 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ATXN8Q156A1 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ATXN8Q156A1 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ATXN8Q156A1 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ATXN8Q156A1 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ATXN8Q156A1 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ATXN8Q156A1 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ATXN8Q156A1 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ATXN8Q156A1 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ATXN8Q156A1 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ATXN8Q156A1 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ATXN8Q156A1 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ATXN8Q156A1 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ATXN8Q156A1 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ATXN8Q156A1 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ATXN8Q156A1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ATXN8Q156A1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ATXN8Q156A1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
ATXN8Q156A1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
ATXN8Q156A1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ATXN8Q156A1 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ATXN8Q156A1 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ATXN8Q156A1 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ATXN8Q156A1 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ATXN8Q156A1 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ATXN8Q156A1 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ATXN8Q156A1 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ATXN8Q156A1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ATXN8Q156A1 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ATXN8Q156A1 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ATXN8Q156A1 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ATXN8Q156A1 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ATXN8Q156A1 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ATXN8Q156A1 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ATXN8Q156A1 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ATXN8Q156A1 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ATXN8Q156A1 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ATXN8Q156A1 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ATXN8Q156A1 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ATXN8Q156A1 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ATXN8Q156A1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ATXN8Q156A1 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ATXN8Q156A1 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ATXN8Q156A1 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ATXN8Q156A1 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ATXN8Q156A1 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ATXN8Q156A1 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ATXN8Q156A1 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ATXN8Q156A1 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ATXN8Q156A1 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ATXN8Q156A1 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ATXN8Q156A1 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ATXN8Q156A1 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ATXN8Q156A1 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ATXN8Q156A1 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ATXN8Q156A1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ATXN8Q156A1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ATXN8Q156A1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ATXN8Q156A1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
ATXN8Q156A1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ATXN8Q156A1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ATXN8Q156A1 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ATXN8Q156A1 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ATXN8Q156A1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
ATXN8Q156A1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
ATXN8Q156A1 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ATXN8Q156A1 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ATXN8Q156A1 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
ATXN8Q156A1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ATXN8Q156A1 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ATXN8Q156A1 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ATXN8Q156A1 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ATXN8Q156A1 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ATXN8Q156A1 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ATXN8Q156A1 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ATXN8Q156A1 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ATXN8Q156A1 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ATXN8Q156A1 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ATXN8Q156A1 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ATXN8Q156A1 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ATXN8Q156A1 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ATXN8Q156A1 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ATXN8Q156A1 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ATXN8Q156A1 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ATXN8Q156A1 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ATXN8Q156A1 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ATXN8Q156A1 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ATXN8Q156A1 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms