Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

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Length 451 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRF4Q15306 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRF4Q15306 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRF4Q15306 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRF4Q15306 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRF4Q15306 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRF4Q15306 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRF4Q15306 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRF4Q15306 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRF4Q15306 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRF4Q15306 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRF4Q15306 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRF4Q15306 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRF4Q15306 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRF4Q15306 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
IRF4Q15306 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
IRF4Q15306 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
IRF4Q15306 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
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