Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
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