Protein–RNA interactions for Protein: Q14761

PTPRCAP, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAPQ14761 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRCAPQ14761 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRCAPQ14761 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRCAPQ14761 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRCAPQ14761 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRCAPQ14761 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRCAPQ14761 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRCAPQ14761 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRCAPQ14761 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRCAPQ14761 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRCAPQ14761 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRCAPQ14761 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRCAPQ14761 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRCAPQ14761 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRCAPQ14761 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRCAPQ14761 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRCAPQ14761 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRCAPQ14761 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRCAPQ14761 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRCAPQ14761 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRCAPQ14761 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRCAPQ14761 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRCAPQ14761 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRCAPQ14761 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRCAPQ14761 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRCAPQ14761 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRCAPQ14761 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRCAPQ14761 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRCAPQ14761 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRCAPQ14761 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRCAPQ14761 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRCAPQ14761 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRCAPQ14761 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRCAPQ14761 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRCAPQ14761 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRCAPQ14761 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRCAPQ14761 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRCAPQ14761 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRCAPQ14761 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRCAPQ14761 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRCAPQ14761 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRCAPQ14761 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRCAPQ14761 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRCAPQ14761 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRCAPQ14761 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRCAPQ14761 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRCAPQ14761 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRCAPQ14761 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRCAPQ14761 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRCAPQ14761 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRCAPQ14761 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRCAPQ14761 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRCAPQ14761 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRCAPQ14761 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRCAPQ14761 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRCAPQ14761 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRCAPQ14761 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRCAPQ14761 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRCAPQ14761 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRCAPQ14761 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRCAPQ14761 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRCAPQ14761 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRCAPQ14761 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRCAPQ14761 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRCAPQ14761 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRCAPQ14761 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRCAPQ14761 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRCAPQ14761 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRCAPQ14761 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRCAPQ14761 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRCAPQ14761 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRCAPQ14761 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRCAPQ14761 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRCAPQ14761 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRCAPQ14761 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRCAPQ14761 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRCAPQ14761 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
PTPRCAPQ14761 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
PTPRCAPQ14761 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
PTPRCAPQ14761 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PTPRCAPQ14761 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PTPRCAPQ14761 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms