Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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