Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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