Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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