Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
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ITGA9Q13797 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
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ITGA9Q13797 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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ITGA9Q13797 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
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ITGA9Q13797 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGA9Q13797 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGA9Q13797 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGA9Q13797 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGA9Q13797 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGA9Q13797 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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ITGA9Q13797 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGA9Q13797 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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ITGA9Q13797 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGA9Q13797 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGA9Q13797 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGA9Q13797 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA9Q13797 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA9Q13797 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA9Q13797 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
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ITGA9Q13797 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA9Q13797 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA9Q13797 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA9Q13797 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA9Q13797 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA9Q13797 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA9Q13797 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA9Q13797 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA9Q13797 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA9Q13797 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA9Q13797 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA9Q13797 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA9Q13797 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA9Q13797 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA9Q13797 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA9Q13797 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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