Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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TUBA3CQ13748 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
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TUBA3CQ13748 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
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TUBA3CQ13748 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
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TUBA3CQ13748 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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TUBA3CQ13748 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
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TUBA3CQ13748 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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TUBA3CQ13748 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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TUBA3CQ13748 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
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TUBA3CQ13748 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
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