Protein–RNA interactions for Protein: Q13557

CAMK2D, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit delta, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2DQ13557 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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