Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
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