Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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