Protein–RNA interactions for Protein: Q13291

SLAMF1, Signaling lymphocytic activation molecule, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF1Q13291 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLAMF1Q13291 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLAMF1Q13291 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLAMF1Q13291 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLAMF1Q13291 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SLAMF1Q13291 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLAMF1Q13291 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SLAMF1Q13291 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLAMF1Q13291 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLAMF1Q13291 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLAMF1Q13291 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLAMF1Q13291 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLAMF1Q13291 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLAMF1Q13291 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLAMF1Q13291 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLAMF1Q13291 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SLAMF1Q13291 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SLAMF1Q13291 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SLAMF1Q13291 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLAMF1Q13291 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLAMF1Q13291 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLAMF1Q13291 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLAMF1Q13291 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLAMF1Q13291 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLAMF1Q13291 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLAMF1Q13291 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLAMF1Q13291 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
SLAMF1Q13291 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLAMF1Q13291 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLAMF1Q13291 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLAMF1Q13291 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLAMF1Q13291 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLAMF1Q13291 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLAMF1Q13291 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLAMF1Q13291 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLAMF1Q13291 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLAMF1Q13291 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLAMF1Q13291 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLAMF1Q13291 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLAMF1Q13291 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLAMF1Q13291 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLAMF1Q13291 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLAMF1Q13291 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLAMF1Q13291 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SLAMF1Q13291 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLAMF1Q13291 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLAMF1Q13291 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLAMF1Q13291 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLAMF1Q13291 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLAMF1Q13291 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SLAMF1Q13291 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SLAMF1Q13291 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLAMF1Q13291 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLAMF1Q13291 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SLAMF1Q13291 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLAMF1Q13291 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLAMF1Q13291 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLAMF1Q13291 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLAMF1Q13291 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLAMF1Q13291 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLAMF1Q13291 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLAMF1Q13291 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLAMF1Q13291 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLAMF1Q13291 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLAMF1Q13291 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLAMF1Q13291 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLAMF1Q13291 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLAMF1Q13291 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SLAMF1Q13291 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLAMF1Q13291 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLAMF1Q13291 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLAMF1Q13291 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLAMF1Q13291 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLAMF1Q13291 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLAMF1Q13291 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLAMF1Q13291 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLAMF1Q13291 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLAMF1Q13291 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLAMF1Q13291 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLAMF1Q13291 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLAMF1Q13291 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLAMF1Q13291 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLAMF1Q13291 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLAMF1Q13291 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLAMF1Q13291 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLAMF1Q13291 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLAMF1Q13291 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLAMF1Q13291 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLAMF1Q13291 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLAMF1Q13291 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLAMF1Q13291 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLAMF1Q13291 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLAMF1Q13291 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLAMF1Q13291 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLAMF1Q13291 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLAMF1Q13291 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLAMF1Q13291 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLAMF1Q13291 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLAMF1Q13291 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLAMF1Q13291 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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