Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RIGQ13278 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RIGQ13278 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RIGQ13278 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RIGQ13278 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RIGQ13278 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RIGQ13278 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RIGQ13278 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RIGQ13278 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RIGQ13278 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RIGQ13278 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RIGQ13278 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RIGQ13278 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RIGQ13278 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RIGQ13278 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RIGQ13278 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RIGQ13278 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RIGQ13278 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RIGQ13278 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RIGQ13278 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RIGQ13278 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RIGQ13278 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RIGQ13278 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RIGQ13278 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RIGQ13278 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RIGQ13278 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RIGQ13278 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RIGQ13278 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RIGQ13278 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RIGQ13278 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RIGQ13278 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RIGQ13278 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RIGQ13278 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RIGQ13278 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RIGQ13278 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RIGQ13278 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RIGQ13278 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RIGQ13278 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RIGQ13278 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RIGQ13278 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RIGQ13278 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RIGQ13278 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RIGQ13278 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RIGQ13278 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RIGQ13278 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RIGQ13278 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RIGQ13278 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RIGQ13278 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RIGQ13278 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RIGQ13278 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RIGQ13278 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RIGQ13278 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RIGQ13278 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RIGQ13278 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RIGQ13278 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RIGQ13278 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RIGQ13278 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RIGQ13278 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RIGQ13278 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RIGQ13278 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RIGQ13278 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RIGQ13278 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RIGQ13278 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
RIGQ13278 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RIGQ13278 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
RIGQ13278 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RIGQ13278 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
RIGQ13278 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RIGQ13278 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RIGQ13278 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RIGQ13278 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RIGQ13278 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RIGQ13278 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RIGQ13278 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RIGQ13278 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RIGQ13278 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RIGQ13278 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RIGQ13278 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RIGQ13278 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
RIGQ13278 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RIGQ13278 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RIGQ13278 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RIGQ13278 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RIGQ13278 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RIGQ13278 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RIGQ13278 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RIGQ13278 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RIGQ13278 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RIGQ13278 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RIGQ13278 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RIGQ13278 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RIGQ13278 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RIGQ13278 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RIGQ13278 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RIGQ13278 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RIGQ13278 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RIGQ13278 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RIGQ13278 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RIGQ13278 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RIGQ13278 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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