Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

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Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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