Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
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