Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXC1Q12948 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
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