Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB40BQ12829 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB40BQ12829 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB40BQ12829 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB40BQ12829 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB40BQ12829 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB40BQ12829 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB40BQ12829 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB40BQ12829 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB40BQ12829 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB40BQ12829 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB40BQ12829 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB40BQ12829 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB40BQ12829 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB40BQ12829 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB40BQ12829 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB40BQ12829 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB40BQ12829 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB40BQ12829 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB40BQ12829 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB40BQ12829 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB40BQ12829 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB40BQ12829 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB40BQ12829 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB40BQ12829 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB40BQ12829 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB40BQ12829 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB40BQ12829 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB40BQ12829 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB40BQ12829 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB40BQ12829 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB40BQ12829 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB40BQ12829 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB40BQ12829 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB40BQ12829 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB40BQ12829 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB40BQ12829 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB40BQ12829 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB40BQ12829 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB40BQ12829 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB40BQ12829 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB40BQ12829 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB40BQ12829 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB40BQ12829 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB40BQ12829 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB40BQ12829 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB40BQ12829 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB40BQ12829 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB40BQ12829 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB40BQ12829 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB40BQ12829 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB40BQ12829 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB40BQ12829 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB40BQ12829 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB40BQ12829 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB40BQ12829 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB40BQ12829 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB40BQ12829 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms