Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms