Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ARHGEF5Q12774 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ARHGEF5Q12774 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ARHGEF5Q12774 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ARHGEF5Q12774 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ARHGEF5Q12774 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
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ARHGEF5Q12774 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
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ARHGEF5Q12774 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ARHGEF5Q12774 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ARHGEF5Q12774 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
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ARHGEF5Q12774 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
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ARHGEF5Q12774 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARHGEF5Q12774 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
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ARHGEF5Q12774 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARHGEF5Q12774 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARHGEF5Q12774 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARHGEF5Q12774 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARHGEF5Q12774 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
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ARHGEF5Q12774 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARHGEF5Q12774 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARHGEF5Q12774 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARHGEF5Q12774 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
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ARHGEF5Q12774 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARHGEF5Q12774 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARHGEF5Q12774 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARHGEF5Q12774 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
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ARHGEF5Q12774 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
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ARHGEF5Q12774 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
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ARHGEF5Q12774 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
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ARHGEF5Q12774 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARHGEF5Q12774 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
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ARHGEF5Q12774 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
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ARHGEF5Q12774 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARHGEF5Q12774 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARHGEF5Q12774 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
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ARHGEF5Q12774 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARHGEF5Q12774 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
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ARHGEF5Q12774 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARHGEF5Q12774 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
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ARHGEF5Q12774 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARHGEF5Q12774 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARHGEF5Q12774 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
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ARHGEF5Q12774 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARHGEF5Q12774 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
ARHGEF5Q12774 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARHGEF5Q12774 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
ARHGEF5Q12774 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARHGEF5Q12774 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARHGEF5Q12774 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARHGEF5Q12774 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARHGEF5Q12774 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARHGEF5Q12774 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARHGEF5Q12774 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARHGEF5Q12774 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARHGEF5Q12774 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARHGEF5Q12774 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARHGEF5Q12774 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARHGEF5Q12774 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARHGEF5Q12774 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
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