Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SREBF2Q12772 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.33■■□□□ 1
SREBF2Q12772 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SREBF2Q12772 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SREBF2Q12772 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
SREBF2Q12772 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SREBF2Q12772 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SREBF2Q12772 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SREBF2Q12772 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SREBF2Q12772 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SREBF2Q12772 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SREBF2Q12772 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SREBF2Q12772 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SREBF2Q12772 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SREBF2Q12772 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SREBF2Q12772 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SREBF2Q12772 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SREBF2Q12772 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SREBF2Q12772 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SREBF2Q12772 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SREBF2Q12772 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SREBF2Q12772 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SREBF2Q12772 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SREBF2Q12772 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SREBF2Q12772 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SREBF2Q12772 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SREBF2Q12772 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SREBF2Q12772 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SREBF2Q12772 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SREBF2Q12772 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SREBF2Q12772 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SREBF2Q12772 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SREBF2Q12772 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SREBF2Q12772 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SREBF2Q12772 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SREBF2Q12772 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SREBF2Q12772 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SREBF2Q12772 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SREBF2Q12772 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SREBF2Q12772 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SREBF2Q12772 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
SREBF2Q12772 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SREBF2Q12772 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SREBF2Q12772 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SREBF2Q12772 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
SREBF2Q12772 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SREBF2Q12772 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SREBF2Q12772 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SREBF2Q12772 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SREBF2Q12772 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SREBF2Q12772 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SREBF2Q12772 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SREBF2Q12772 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SREBF2Q12772 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SREBF2Q12772 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SREBF2Q12772 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SREBF2Q12772 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SREBF2Q12772 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SREBF2Q12772 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SREBF2Q12772 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SREBF2Q12772 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SREBF2Q12772 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SREBF2Q12772 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SREBF2Q12772 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SREBF2Q12772 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SREBF2Q12772 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SREBF2Q12772 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
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