Protein–RNA interactions for Protein: Q12765

SCRN1, Secernin-1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCRN1Q12765 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCRN1Q12765 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCRN1Q12765 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCRN1Q12765 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCRN1Q12765 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCRN1Q12765 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCRN1Q12765 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCRN1Q12765 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SCRN1Q12765 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCRN1Q12765 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SCRN1Q12765 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SCRN1Q12765 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCRN1Q12765 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCRN1Q12765 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCRN1Q12765 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SCRN1Q12765 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCRN1Q12765 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCRN1Q12765 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCRN1Q12765 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCRN1Q12765 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCRN1Q12765 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCRN1Q12765 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCRN1Q12765 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCRN1Q12765 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCRN1Q12765 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCRN1Q12765 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCRN1Q12765 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCRN1Q12765 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCRN1Q12765 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCRN1Q12765 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCRN1Q12765 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCRN1Q12765 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCRN1Q12765 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCRN1Q12765 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCRN1Q12765 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCRN1Q12765 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCRN1Q12765 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCRN1Q12765 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCRN1Q12765 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCRN1Q12765 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SCRN1Q12765 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCRN1Q12765 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCRN1Q12765 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SCRN1Q12765 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCRN1Q12765 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCRN1Q12765 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCRN1Q12765 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCRN1Q12765 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCRN1Q12765 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCRN1Q12765 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SCRN1Q12765 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SCRN1Q12765 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCRN1Q12765 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCRN1Q12765 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCRN1Q12765 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SCRN1Q12765 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCRN1Q12765 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCRN1Q12765 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCRN1Q12765 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCRN1Q12765 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCRN1Q12765 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCRN1Q12765 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCRN1Q12765 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCRN1Q12765 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCRN1Q12765 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCRN1Q12765 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCRN1Q12765 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCRN1Q12765 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCRN1Q12765 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCRN1Q12765 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCRN1Q12765 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SCRN1Q12765 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCRN1Q12765 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCRN1Q12765 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCRN1Q12765 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCRN1Q12765 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCRN1Q12765 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCRN1Q12765 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCRN1Q12765 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCRN1Q12765 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCRN1Q12765 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCRN1Q12765 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCRN1Q12765 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCRN1Q12765 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCRN1Q12765 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCRN1Q12765 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCRN1Q12765 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCRN1Q12765 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCRN1Q12765 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCRN1Q12765 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCRN1Q12765 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCRN1Q12765 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCRN1Q12765 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SCRN1Q12765 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCRN1Q12765 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCRN1Q12765 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCRN1Q12765 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCRN1Q12765 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCRN1Q12765 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCRN1Q12765 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
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