Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms