Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms