Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms