Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms